Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00336Q6ZUF6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00336Q6ZUF6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms