Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
UBR3Q6ZT12 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBR3Q6ZT12 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBR3Q6ZT12 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
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