Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms