Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RUFY4Q6ZNE9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUFY4Q6ZNE9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms