Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOCD1Q6ZMY3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms