Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DPPA3Q6W0C5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DPPA3Q6W0C5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms