Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms