Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCIMPQ6UWF3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms