Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE2Q6PIF2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE2Q6PIF2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms