Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL35Q6PF15 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL35Q6PF15 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL35Q6PF15 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms