Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKN3Q6P5Z2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKN3Q6P5Z2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms