Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C22orf39Q6P5X5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms