Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6P435 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6P435 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6P435 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6P435 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6P435 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6P435 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6P435 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6P435 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6P435 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6P435 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6P435 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6P435 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6P435 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6P435 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6P435 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6P435 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6P435 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6P435 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6P435 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6P435 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6P435 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6P435 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6P435 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6P435 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6P435 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6P435 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6P435 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6P435 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6P435 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6P435 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6P435 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6P435 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6P435 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6P435 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6P435 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6P435 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6P435 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6P435 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6P435 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6P435 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6P435 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6P435 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6P435 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6P435 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6P435 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6P435 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6P435 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6P435 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6P435 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6P435 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6P435 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6P435 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6P435 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6P435 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6P435 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6P435 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms