Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRAMD4Q6IC98 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms