Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUMO4Q6EEV6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms