Protein–RNA interactions for Protein: Q63HQ0

AP1AR, AP-1 complex-associated regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1ARQ63HQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1ARQ63HQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1ARQ63HQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1ARQ63HQ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1ARQ63HQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP1ARQ63HQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP1ARQ63HQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1ARQ63HQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms