Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SUSD4Q5VX71 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SUSD4Q5VX71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUSD4Q5VX71 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms