Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF8Q5VWM4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF8Q5VWM4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms