Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATRNL1Q5VV63 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATRNL1Q5VV63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms