Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFMBT2Q5VUG0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFMBT2Q5VUG0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms