Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM164Q5U3C3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM164Q5U3C3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms