Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3CD-AS1Q5SR53 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms