Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL4Q5MAI5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms