Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIA3Q5JRA6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIA3Q5JRA6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIA3Q5JRA6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms