Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
XKR3Q5GH77 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XKR3Q5GH77 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XKR3Q5GH77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms