Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms