Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN2Q52LD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms