Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3BQ502W6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms