Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAL1Q4LDG9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAL1Q4LDG9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms