Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms