Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CERKLQ49MI3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CERKLQ49MI3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CERKLQ49MI3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms