Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPTABQ3T906 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GNPTABQ3T906 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms