Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTC1Q2NKJ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTC1Q2NKJ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTC1Q2NKJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms