Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL24A1Q17RW2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
COL24A1Q17RW2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL24A1Q17RW2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
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