Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC142Q17RM4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC142Q17RM4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC142Q17RM4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
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