Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD2Q16342 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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