Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
VPS72Q15906 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VPS72Q15906 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
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