Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIX1Q15475 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX1Q15475 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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