Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC23AQ15436 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23AQ15436 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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