Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3CQ15386 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UBE3CQ15386 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBE3CQ15386 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms