Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRRQ15256 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRRQ15256 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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