Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDGFRLQ15198 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFRLQ15198 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFRLQ15198 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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