Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD6Q15008 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD6Q15008 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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