Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CTTNQ14247 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTTNQ14247 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTTNQ14247 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms