Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGQ13641 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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