Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTCH1Q13635 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTCH1Q13635 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTCH1Q13635 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PTCH1Q13635 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
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