Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NEUROD1Q13562 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEUROD1Q13562 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEUROD1Q13562 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NEUROD1Q13562 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
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