Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRQ13535 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRQ13535 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRQ13535 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRQ13535 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRQ13535 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRQ13535 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRQ13535 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRQ13535 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRQ13535 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRQ13535 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRQ13535 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRQ13535 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATRQ13535 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATRQ13535 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATRQ13535 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATRQ13535 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRQ13535 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRQ13535 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRQ13535 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRQ13535 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRQ13535 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRQ13535 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRQ13535 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRQ13535 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATRQ13535 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATRQ13535 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATRQ13535 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATRQ13535 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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