Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B2Q13367 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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