Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATMQ13315 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATMQ13315 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATMQ13315 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATMQ13315 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATMQ13315 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATMQ13315 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATMQ13315 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATMQ13315 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATMQ13315 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATMQ13315 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATMQ13315 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATMQ13315 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATMQ13315 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
ATMQ13315 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATMQ13315 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ATMQ13315 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATMQ13315 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATMQ13315 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMQ13315 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATMQ13315 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMQ13315 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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